El 23 de marzo de 1677, fue nombrado pastor de la Iglesia Bautista Wapping Particular en Londres, situada en ese momento entre Broad Street y Old Gravel Lane. Dios bendijo su ministerio y, diez años después, a finales del verano de 1687, Collins trasladó la congregación a otro lugar de Londres. La congregación erigió un nuevo edificio para el culto en James Street en Stepney. La audacia de la medida (aún no se había declarado la tolerancia religiosa en Inglaterra y Gales) mostró el vigoroso liderazgo que Collins ejerció tanto dentro de su propia iglesia como en la comunidad calvinista bautista más amplia de Londres.